Я решил эту проблему самостоятельно. Я создал CLR .Net Stored Proc с принимает параметр BLOB. Этот BLOB - просто список сериализованных INT. Его можно десериализовать, используя T-SQL или .Net CLR SP. .Net CLR SP имеет лучшую производительность, что было очень важно для моего проекта.

Хотя этот вопрос касался SQL Server 2008, и хотя в то время было невозможно передать табличные параметры, сейчас это так. Это задокументировано здесь в руководстве по драйверу JDBC . Например, это можно сделать так:

SQLServerDataTable table = new SQLServerDataTable();
table.addColumnMetadata("i" ,java.sql.Types.INTEGER);
table.addRow(1);
table.addRow(2);
table.addRow(3);
table.addRow(4); 

try (SQLServerPreparedStatement stmt=
    (SQLServerPreparedStatement) connection.prepareStatement(
       "SELECT * FROM some_table_valued_function(?)")) {

    // Magic here:
    stmt.setStructured(1, "dbo.numbers", table);  

    try (ResultSet rs = stmt.executeQuery()) {
        ...
    }
}

Я также недавно написал об этом здесь .